Archiv Masarykovy univerzity vznikl v roce 1936. Spravoval zpočátku převážně dokumenty rektorátu, fakult a ústavů, od 60. let pak začal vyhledávat osobní pozůstalosti významných pracovníků univerzity. V současnosti (2017) je v něm uloženo 135 takových fondů. Kromě nich tvoří fondy a sbírky archivu materiály vysokoškolských spolků, materiály vizuální - fotografie, obrazy, audiovizuální záznamy, ale také textilie, modely etc. V době socialismu, kdy bylo archivnictví v Československu přísně centralizováno do hierarchické sítě územněsprávních archivů, byl Archiv Masarykovy univerzity jediným oficiálním archivem instituce mimo hlavní město Prahu.