Centrum zahájilo svoji činnost k 11. 5. 1993. Impulsem k založení byla aktivita studentů Katedry humanitních věd a evropských studií, kteří v roce 1992 navštívili USA a zde potkali československé krajany a exulanty. V roce 1993 tedy vzniklo výzkumné a dokumentační středisko pro studium česko-slovenského exilu. Centrum má hlavně vědeckovýzkumnou a dokumentační funkci, kterou plní skrze výzkumné projekty, granty a podporu krajanů. Centrum kooperuje s dalšími odbornými pracovišti a to včetně samotných krajanských organizací, spolků, sdružení, ale také s vědeckými pracovišti, institucemi a jednotlivci.

Po založení mělo Centrum několik cílů, které se snažilo naplňovat. Prvním jistě bylo systematické zpracovávání dějin Čechů a Slováků, kteří emigrovali z Československa, s důrazem na emigranty po roce 1948. Od roku 1995 se Centrum podílelo, či samo řešilo několik grantových projektů: Československá exilová politika po roce 1948, České krajanské komunity v zahraničí (společně s Ústavem pro etnografii a folkloristiku Akademie věd ČR), Československý exil v letech 1948 – 1989, Výzkum emigrace z českých zemí v novověku, a další.

Archiv centra byl dočasně přestěhován mezi lety 2016 – 2018 z důvodu rekonstrukce budovy, v roce 2018 byl přesunut zpátky do budovy Katedry historie v Olomouci a v plánu je rozsáhlá inventarizace archiválií.